Le Covid-19 perturbe le microbiote et provoque de graves infections sanguines
En perturbant l'équilibre et la diversité des bactéries intestinales, le Covid-19 favoriserait le développement de "bactériémies", de graves infections du sang.
Jour après jour, le coronavirus ne cesse de nous surprendre. Selon une nouvelle étude parue dans la revue Nature Communications, l’infection par le virus entraînerait ainsi une modification du microbiote intestinal et pourrait donc être à l’origine de graves surinfections bactériennes.
Un déséquilibre de la flore à l’origine de surinfections bactériennes
"Ici, nous fournissons des preuves que la dysbiose du microbiome intestinal est associée à la translocation de bactéries dans le sang pendant le Covid-19, provoquant des infections secondaires potentiellement mortelles", confirme l’équipe de virologues de la NYU Langone Health.
Pour mieux comprendre ces effets du Covid, les chercheurs ont infecté des dizaines de souris par voie intranasale avec le coronavirus puis ont analysé la composition bactérienne de leurs selles. C’est ainsi qu’ils se sont rendus compte que le coronavirus pouvait perturber directement le microbiome, en dehors de tout traitement médicamenteux (antibiotiques).
Ils ont ensuite prélevé des échantillons de selles et de sang de 96 patients infectés par le virus et hospitalisés.
Résultat : ces tests ont révélé un déséquilibre important de la flore intestinale des patients.
La majorité d'entre eux présentait une faible diversité de bactéries (25 % des microbes appartenaient à une seule espèce bactérienne). Chez ces mêmes malades, des espèces bactériennes résistantes aux antibiotiques avaient proliféré et enfin, certaines bactéries résistantes aux antimicrobiens avaient migré dans le sang de 20 % des patients hospitalisés.
En outre, les antibiotiques (pris ici en début de pandémie) semblaient aggraver la perte de diversité microbienne.
"Nous sommes les premiers à détecter des effets sur les cellules épitheliales (de la paroi intestinale, ndlr) et à montrer que les antibiotiques peuvent aggraver la situation", révèle à ce titre Lucie Bernard-Raichon, autrice principale de ces travaux.
Des conclusions, qui n’étonnent pas le Dr Kierzerk, directeur médical de Doctissimo.
"En cas de Covid sévère, un dysfonctionnement de l'ensemble des "cascades inflammatoires" apparaît : le tube digestif devient perméable, le système immunitaire s’emballe. C’est le même mécanisme que le sepsis, une infection grave caractérisée par une réponse inflammatoire inappropriée", assure l’expert, avant d’ajouter "qu’il est probable que des individus soient prédisposés génétiquement à ce problème".
Le médecin urgentiste précise qu’il est essentiel de ne pas déséquilibrer davantage le microbiote avec des antibiotiques. Toute forme de prévention à l’aveugle est à éviter.